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2026年初，中国科学院南京分院、长春分院不再保留，分别并入上海分院、沈阳分院的消息发布。1月6日，江苏省级党媒“交汇点”新闻客户端发文表示，对南京乃至江苏而言，分院调整难免引发对区域科创地位的讨论，“但回归调整的本质与科研实际，这场变革更应被视为区域创新资源优化配置的契机——江苏的科创实力基于长期积累的科研底蕴与平台基础，并未因行政架构调整而改变，反而在长三角协同格局中获得更高效的资源对接通道。”
“此次分院调整的核心逻辑是打破区域行政壁垒，让科研资源按创新规律自由流动。”报道称，长三角是我国科技创新核心承载区，南京分院并入上海分院后，管理层级简化让江苏的科研力量直接嵌入长三角“基础研究—技术攻关—成果转化”创新链。南京的原始创新成果可快速对接上海的产业需求与国际合作平台，借助苏州的制造产能实现规模化转化，结合杭州的数字技术拓展应用场景，形成创新合力。江苏基础研究、高端人才储备的长板是长三角科创生态不可或缺的一环，长三角的整体资源优势也为江苏科研成果的落地转化提供更广阔的市场与平台，实现“1+12”的区域共赢。
南京分院并入上海分院后，江苏作为长三角科创走廊重要节点，将更直接地参与国家级重大科研项目的统筹推进。在平台支撑上，可更顺畅地共享长三角范围内大型科研仪器、数据库等资源；项目布局上，能更高效地承接量子科技、生物医药、先进材料等领域的联合攻关任务；国际合作上，可更便捷地借助上海的国际化平台，拓展科研交流与成果推广渠道。既契合江苏打造具有全球影响力的产业科技创新中心的区域目标，也服务于长三角冲刺世界级科创中心的国家战略，让区域科研力量更好地融入国家科技自立自强的整体布局，“南京分院的调整并非区域科创地位的‘弱化’，而是科研管理体系从‘区域分割’向‘使命导向’转型的必然结果。”
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